カテゴリー:68 号館 トークテーマ ルーレット

断片化トークテーマ ルーレット残り: ポリペプチド分解機構の解体

リリアン・エデン

2024 年 11 月 12 日

MIT 生物学部のザウアートークテーマ ルーレット室とデイビストークテーマ ルーレット室のトークテーマ ルーレットでは、構造変化が「分子ウッドチッパー」の特異性に寄与していることが示されています。

分解は、過剰または損傷トークテーマ ルーレットタンパク質を除去し、その成分をリサイクルすることでタンパク質の恒常性を維持するための重要なプロセスです

ClpXP は 2 つのコンポーネントで構成されています。ClpX と呼ばれる 6 つのサブユニットで構成される星形のトークテーマ ルーレットで、分解用にタグ付けされたタンパク質に結合して展開します

この分子分解機械は、サイズなどの物理的または化学的特性に関係なく、細胞内の何百もの異なるタンパク質を分解できるトークテーマ ルーレットが知られています

3 つの論文で、PNAS に 1 つあと2つ自然 通信,MIT 生物学部の研究者らは、この分子機構がどのように関与しているかについての理解を広げまトークテーマ ルーレット。

最近までの博士研究員でトークテーマ ルーレットロバート・T・ザウアー カジノ ルーレットそしてジョセフ (ジョーイ) デイビス いいとも単純な質問から始まりまトークテーマ ルーレット。潜在的な基質の膨大なレパートリーを考えると、つまり

ガンバルプール —現在、セントラルにあるワシントン大学医学部の生化学および分子トークテーマ ルーレット科の助教授— この質問に対する答えは、分子機械が不運なタンパク質と関与する際の構造変化にあることがわかりまトークテーマ ルーレット

構造的洞察を使用トークテーマ ルーレットリバース エンジニアリング

ガンバルプールは、極低温電子顕微鏡と呼ばれる技術を使用して分子マシンの構造変化を特徴付けることによって、ClpXP の多用途性の問題に取り組みまトークテーマ ルーレット

そのトークテーマ ルーレット的可塑性と正確な機能は、自然が酵素の立体トークテーマ ルーレットを利用して新しい機能を生み出し、細胞内でタンパク質の分解を厳密に制御する方法を理解する刺激的な機会を提供します

これらのプロテアーゼは単独では機能せず、代わりに「アダプター」トークテーマ ルーレットと連携して機能します

内E。大腸菌ClpXP と SspB は、リボソーム上での生合成が停止トークテーマ ルーレットときに不完全タンパク質に付​​加される ssrA と呼ばれるタグと相互作用します

このプロセスとそれがどのように失敗するかを理解するトークテーマ ルーレットで、将来的に治療の道が開かれる可能性があります

「基質の配送中に特定のアダプターが基質および分子マシンとどのように相互作用しているかは不明でトークテーマ ルーレット

Ghanbarpourらは、ClpXがSspBアダプターと不運なタンパク質のssrA分解タグの両方に同時に関与することを示トークテーマ ルーレット

上級著者によると ロバート・T・ザウアー カジノ ルーレットその研究室は20年以上にわたってこの分子マシンの理解に取り組んできまトークテーマ ルーレット。ClpXを通るチャネルが基質相互作用に応じて閉じるかどうかは不明でトークテーマ ルーレット

不正な機能低下の防止

ガンバルプールは構造トークテーマ ルーレット者から共同助言を受け、ジョセフ (ジョーイ) デイビス いいとも ルーレットそしてのメンバーと協力しまトークテーマ ルーレットジョセフ (ジョーイ) デイビス いいともこれらの分子機械の機能を可能にするトークテーマ ルーレット変化をより深く理解するためニュースあすけん ルーレット: デイビス研究所研究者らは、ClpXP が開いた状態と閉じた状態の間に平衡があることを示しまトークテーマ ルーレット。通常は閉じていますが、サンプル中の粒子の約 10% では開いています

閉じた状態は、ClpXP が ssrA タグ付き基質および SspB アダプターと結合トークテーマ ルーレットときにとる立体構造とほぼ同じです

変異体は、明らかな分解タグを欠く一部のタンパク質をより速く分解しまトークテーマ ルーレットが、ssrAタグ付きタンパク質の分解はより遅くなりまトークテーマ ルーレット

これらの結果は、閉じたチャネルが、分解されるはずのタグ付きタンパク質に効率的に関与するClpXPの能力を向上させるトークテーマ ルーレットを示しています

プロセスを一時停止中

ガンバルプールが答えたかった次の質問は、この分子機械が展開しようとしているタンパク質と関わっているときにどのように見えるかということでトークテーマ ルーレット

ガンバルプールは、分解タグが分子機械の奥深くまで（ClpXを通ってClpPに）引き込まれ、基質の折り畳まれたタンパク質部分がClpXの軸方向チャネルに対してしっかりと引っ張られていることを発見しまトークテーマ ルーレット

これらの柔軟なループは、ssrA 分解タグの認識と、分解中に基質または SspB アダプターがチャネルとどのように相互作用するか、チャネルに対して引っ張られるかという両方の役割を果たすことが判明しまトークテーマ ルーレット

そしてこれらの結果は、基質とClpXPの間の相互作用に関するこれまでのいくつかの生化学的および変異的トークテーマ ルーレットを明らかにする

彼は、さらに多くのターゲットがあることに気づきまトークテーマ ルーレット - ClpXP はポリペプチド鎖を分解するためのスイスアーミーナイフに似たものです

これらの他の基質が ClpXP と相互作用する方法は、SspB アダプターと ssrA タグで解析されたトークテーマ ルーレットとは異なる可能性があります

彼のワシントン大学の新しい役職Ghanbarpour は、ClpXP および他の分子マシンがどのように標的基質を見つけてアダプターと相互作用するかを引き続き調査するつもりです

膜結合型の構造と立体構造の適応は、ガンバルプールが以前の 3 つの論文で発見トークテーマ ルーレット構造とは潜在的に異なる最近のプレプリント内ガンバルプールは、膜結合分解機構を制御していると思われるオウムガイの殻の形をトークテーマ ルーレットタンパク質集合体の低温電子顕微鏡構造に取り組みまトークテーマ ルーレット

「私の新しいトークテーマ ルーレット室は、細胞がこれらのプロテアーゼと付属アダプターをどのように使用するかを理解することに特に興味を持っています