癌に対する計算的アプローチ
トニー・アン・ネルソンは、夏の遠隔ルーレット アイコンを、腫瘍を分析するための新しいツールセットを学ぶ機会に変えました.
ローリー マケルベリー
トニーアン・ネルソンは、9歳で祖父を病気で亡くして以来、癌の治療法を見つけたいと考えていました. 「医師や科学者に何か欠けているものがあるに違いないと思ったのを覚えています,”彼女は思い出します. 「そんなに複雑なことはあり得ない.”分子ルーレット アイコンの学位取得まであと 1 学期, ネルソンは癌がまさに複雑なものであることに気づいています. 期間中に癌研究を行った後 MIT のルーレット アイコンにおける夏季研究プログラム (メーカー希望小売価格-バイオ), 彼女は腫瘍と転移の複雑さについてさらに理解しています. しかし、彼女はまた、どれほど多くの携帯電話のパズルがまだ解決されていないのかを垣間見た.
ジャマイカで育つ, ネルソンは科学の授業をすべて楽しみました, しかし彼女はルーレット アイコンを好んだ、なぜならそれが癌を調査するための基礎になると知っていたから. 彼女は高校のクラスの総代として卒業しました, ミシシッピ州アルコーン州立大学への奨学金を獲得, 2017 年の春に彼女が始めた場所.
アルコーンにはがん研究施設がありません, それでネルソンはヤン・メンの植物組織培養研究室で学部研究員としての地位を確保した. 3年間, ネルソンはサツマイモのウイルス病抵抗性の向上を目指した. 彼女は臨床研究を行っていなかったにもかかわらず, 彼女は PCR などの主要な分子ルーレット アイコン技術を習得しました, ゲル電気泳動, および組織培養.
「多くの場合、治療法を見つけるには基礎から始める必要があるため、基礎ルーレット アイコンが重要です, そして細胞内で何が起こっているかを理解する,”彼女は言います.
ネルソンが MSRP-Bio に として受け入れられたとき グールドフェロー そしてで働くよう割り当てられました タイラー ジャックス' ルーレット アイコン室, 彼女は初めてのガンルーレット アイコンの実地体験に大喜びしました. しかし、プログラム開始予定の 2 か月前の 2020 年 4 月に、MIT のキャンパスは新型コロナウイルス感染症のパンデミックにより一時的に閉鎖されました, そして MSRP-Bio 2020 はリモート学習体験になりました.
その結果, ネルソンと彼女の MSRP-Bio 仲間は自宅からルーレット アイコンを実施しました. 彼女はリモートワークに適した計算集約型のプロジェクトに取り組み、オンラインの定量的手法のクラスを受講する必要がありました. 数週間かけて, 彼女は全く新しいスキルを学びました, Python などのプログラミング言語を含む.
「がんルーレット アイコンの一環として、そのような種類の計算ツールは必要ないといつも思っていました,”彼女は説明します. 「しかし、MIT で働くことは啓発的なものでした, それが病気を理解する鍵であることがわかったから. 将来的には自分のプロジェクトでそれらを使用することになるのは間違いありません.”
ジャックスのルーレット アイコン室は、癌の一因となる遺伝的事象をルーレット アイコンしています, そして肺腺癌を中心としたネルソンのプロジェクト. 非小細胞肺癌の主な形態, 肺胞 II 型 (AT2) 細胞で始まります. 過去のルーレット アイコンでは、, 腫瘍が進行するにつれて, AT2 セルの状態が変化し、元のアイデンティティが失われる. ネルソンは、どの遺伝子とタンパク質がこの進化の根底にあるのかを突き止めたいと考えていました. 彼女の分析は、AT2 細胞に特徴的な遺伝マーカーが時間の経過とともに減少する傾向があることを示しました, 急速に成長する「高悪性度」腫瘍を示すマーカーがより蔓延している一方で.
「初期に起こっているこれらの遺伝子発現変化の動態はまだ十分に理解されていない,”彼女は説明します. 「これは、この病理がいかに複雑であるかを示しています, さらに魅力的だと思います.”
ルーレット アイコン者ががん細胞の状態の変化を引き起こす遺伝子とタンパク質を正確に特定できるようになったら, 転移プロセスを標的にして予防する薬剤を設計する能力がさらに高まる.
ネルソンは直接ルーレット アイコン室を訪れることができませんでしたが, キャンパス内でのルーレット アイコンがゆっくりと再開し始めた頃, 彼女の大学院生のメンター、アマンダ クルーズがビデオ会議中に彼女を案内してくれました. クルーズはネルソンの科学文献の探索も手伝いました, ルーレット アイコン室のジャーナルクラブのルーレット アイコンを選択, 計算分析を実行します.
前例のない状況を考慮して, ネルソンさんは、充実したサポート システムが成功の鍵だったと語る. ネルソンと彼女のメーカー希望小売価格の仲間も、お互いに励ましを頼りにしていました, ルーレット アイコン室外での指導のため、それぞれに大学院生の「友達」が割り当てられました.
「ルーレット アイコンは私たちのあらゆるニーズに応えてくれました, そして、あなたが孤独を感じている場合、誰かが常にあなたの様子をチェックしてくれるように構成されています,”ネルソンは言います. 「この経験からこれほど多くのことが得られるとは予想していませんでした, 特に物理的にキャンパスにいないので. しかし、この夏私が学んだことは、私が予想していた以上のものでした.”
ジャックスの研究室で過ごした時間が、彼女の癌研究への熱意を確固たるものにした, そして彼女は、この一連の研究を続けるために癌ルーレット アイコンの博士課程プログラムに応募するつもりです. 「学ぶべきことがまだたくさんあることに気づきました,”彼女は言います, 「しかし、私たちはそこに到着しています.”