Sergey Ovchinnikov

セルゲイ・オフチニコフ ルーレット 遊び方

ルーレット 遊び方の助教授

セルゲイ・オフチニコフは環境環境下でタンパク質の構造と進化を研究, ルーレット 遊び方, ゲノム, 構造, そして分子スケール.

68-533A

オフィス

so3@ルーレット 遊び方t.edu

メール

建物 68 - コッホルーレット 遊び方棟

場所

ルーレット 遊び方室のウェブサイト
マーサ ファム

アシスタント

617-258-7851

アシスタントの電話

教育

  • 卒業生: 博士号, 2017, ワシントン大学
  • 学部: BS, 2010, ミクロ/分子ルーレット 遊び方, ポートランド州立大学

ルーレット 遊び方概要

セルゲイ・オフチニコフは系統推論を使用する, タンパク質構造の予測/決定, タンパク質設計, ディープラーニング, エネルギーベースのモデル, 環境における進化の問題に取り組むための微分可能プログラミング, ルーレット 遊び方, ゲノム, 構造, そして分子スケール, タンパク質進化の統一モデルを開発することを目的.

最近の出版物

  1. タンパク質言語モデルは相互作用する配列モチーフの進化統計を学習. 張, Z, ウェイメント・スティール, 香港, ブリクシ, G, ワン, H, カーン, D, オフチニコフ, S. 2024. Proc Natl Acad Sci USA 121, e2406285121.
    ドイ: 10.1073/プナス.2406285121Pルーレット 遊び方D:39467119
  2. 緩和された配列空間での最適化を使用したスケーラブルなタンパク質設計. フランク, C, コショウエイ, A, フβ, L, シヴィエッツ, D, プッツ, D, ウェーバー, L, 趙, Z, 服部, M, フォン, S, デ・スティグテル, Y 他. 2024. 科学 386, 439-445.
    ドイ: 10.1126/科学.adq1741Pルーレット 遊び方D:39446959
  3. ColabFold を使用した簡単かつ正確なタンパク質構造予測. キム, G, リー, S, レヴィ カリン, E, キム, H, 森脇, Y, オフチニコフ, S, シュタイネッガー, M, ミルディタ, M. 2024. ナット プロトック , .
    ドイ: 10.1038/s41596-024-01060-5Pルーレット 遊び方D:39402428
  4. 可溶性および機能性膜タンパク質類似体のコンピューター設計. ゴベルデ, カナダ, パセサ, M, ゴールドバッハ, N, ドルンフェルド, LJ, バルビ, ペム, ジョージオン, S, ロセット, S, カプール, S, チョードリー, J, ダウパラ, J 他. 2024. 自然 631, 449-458.
    ドイ: 10.1038/s41586-024-07601-yPルーレット 遊び方D:38898281
  5. 新たに設計された水溶性および膜貫通型の検証β-バレル by インシリコ 折りたたむと溶ける。 エルモシラ, 午前, バーナー, C, オフチニコフ, S, ヴォロビエワ, AA. 2024. タンパク質科学 33, e5033.
    ドイ: 10.1002/pro.5033Pルーレット 遊び方D:38864690
  6. ゲノム言語モデルはタンパク質の共制御と機能を予測. ファン, Y, コーンマン, アル, ケロッグ, えっ, オフチニコフ, S, ギルギス, PR. 2024. ナットコミューン 15, 2880.
    ドイ: 10.1038/s41467-024-46947-9Pルーレット 遊び方D:38570504
  7. 内在性膜タンパク質の可溶性機能類似体の計算機設計. ゴベルデ, カナダ, パセサ, M, ゴールドバッハ, N, ドルンフェルド, LJ, バルビ, ペム, ジョージオン, S, ロセット, S, カプール, S, チョードリー, J, ダウパラ, J 他。 2024.bioRxiv、.
    ドイ: 10.1101/2023.05.09.540044Pルーレット 遊び方D:38496615
  8. 生命の領域にわたるタンパク質のホモオリゴマー化に関するアトラス. シュヴェケ, H, パセサ, M, レビン, T, ゴベルデ, カナダ, クマール, P, ドゥフー, Y, ドルンフェルド, LJ, デュブルイユ, B, ジョージオン, S, オフチニコフ, S 他. 2024. セル 187, 999-1010.e15.
    ドイ: 10.1016/j.セル.2024.01.022Pルーレット 遊び方D:38325366
  9. 配列クラスタリングと AlphaFold2 による複数の立体構造の予測. ウェイメント・スティール, 香港, オジョアウォ, A, オッテン, R, アピッツ, JM, ピツウォン, W, ホンベルガー, M, オフチニコフ, S, コルウェル, L, カーン, D. 2024. 自然 625, 832-839.
    ドイ: 10.1038/s41586-023-06832-9Pルーレット 遊び方D:37956700
  10. 地球規模のメタゲノミクスによる機能的暗黒物質の解明. パブロプロス, 一般提供, バルトゥーマ, FA, リュー, S, セルヴィトピ, O, カマルゴ, AP, ナイファック, S, アザド, A, ルー, S, 電話, L, イワノバ, NN 他. 2023. 自然 622, 594-602.
    ドイ: 10.1038/s41586-023-06583-7Pルーレット 遊び方D:37821698
その他の出版物