細胞運命の変化の計算
ミーナ チャクラボルティ '19 は、ノーベル賞受賞者フィリップ シャープのパズドラ ルーレット室で 2 年間を過ごし、コンピューター サイエンスとウェット ラボ技術を組み合わせて、遺伝子発現に対するマイクロ RNA の影響をパズドラ ルーレットしました。
ローリー・マケルベリー
ミーナ・チャクラボーティが11歳のとき、両親は故郷のマサチューセッツ州レキシントン以外の生活がどのようなものかを見せるために彼女を南アフリカに連れて行きました。この旅行は何よりもまず家族旅行でしたが、現在マサチューセッツ工科大学の3年生であるチャクラボルティさんの心を打ったのは、観光スポットでもサファリでもなく、小児病院への訪問でした。
「そこにいた患者たちが私と同じ年齢だったことに驚いたのを覚えています」と彼女は言います。 「彼らがHIVと闘い、生き残れないかもしれない間、私には人生で楽しみにしていたことがすべてありました。
その時点まで、彼女は作家になるつもりでした。そのため、大学を選ぶ段になったとき、彼女は当初、パズドラ ルーレットT が「テクノロジーに焦点を当てすぎている」ことを恐れて、パズドラ ルーレットT を避けました。
「私は主にパズドラ ルーレットに興味がありましたが、それでも学問分野や周囲の人々の多様性を望んでいました」と彼女は言います。 「しかし、MIT が自分の専攻の外に出ることを本当に奨励していることが明らかになりました。人文科学、芸術、または社会科学の集中そして私は哲学を選びました。これらの授業は私の学部での経験の定番となっており、科学に集中しながらも書くことへの愛情を維持することができました。」
彼女の数学の傾向を考えると、彼女はこう宣言しましたコース 6-7(コンピューター科学と分子パズドラ ルーレット)、大規模なデータセットを解読し、パズドラ ルーレット的システムをより深く理解するための分析ツールを開発する手段として。 1 年生の夏、彼女は現実世界の環境でこれら 2 つのスキルを融合する初めての機会を得ました。彼女は、 の研究室で働き始めました。ノーベル賞勝者フィリップ・シャープ、 にありますコッホ統合癌パズドラ ルーレットパズドラ ルーレット所.
これは彼女にとって計算パズドラ ルーレットへの初めての取り組みでしたが、コッホ大学に来たのは初めてではありませんでした。彼女はコッホ大学で 2 人の大学院生を指導していました。アーバインパズドラ ルーレット所高校三年生の夏。しかし今回は学部生として、博士パズドラ ルーレット員のサリル・ガーグ氏の指導の下、彼女自身のプロジェクトが割り当てられた。
メッセンジャー RNA (mRNA) — おそらく RNA の中で最もよく知られている — は、DNA と遺伝子発現の最終産物であるタンパク質との間の中間段階を構成します。対照的に、パズドラ ルーレットRNA はタンパク質に翻訳されることはありません。
この パズドラ ルーレットRNA によるサイレンシングは広範かつ複雑です。場合によっては、パズドラ ルーレットRNA が単一の遺伝子をサイレンシングします。
Chakraborty 氏は次に、蛍光活性化細胞選別 (FACS) として知られる技術を使用して、非古典的 パズドラ ルーレットRNA が胚性幹細胞における遺伝子発現にどのような影響を与えるかを調べました。彼女は、FACS アッセイを使用して パズドラ ルーレットRNA 活性を検出し、特別な DNA を操作してマウス ES 細胞に挿入しました。
「パズドラ ルーレットRNA が活性化すると、赤色蛍光タンパク質の発現は低下しますが、青色蛍光タンパク質の発現は低下しないことがわかっています」と彼女は言います。 「そして、それはまさにこれらの非古典的 パズドラ ルーレットRNA で私たちが観察したことであり、それらが細胞内で活性であることを示唆しています。」
チャクラボルティは、この発見ががんパズドラ ルーレットにとって何を意味するかについて興奮しています。 miRNA が胚性幹細胞の細胞状態間の相互変換を助けることができない場合に一部のがんが発生することを示すパズドラ ルーレットが増えています。
チャクラボルティさんは週に 4 ～ 20 時間を研究室で過ごしていますが、課外活動も忘れていません。パズドラ ルーレット学部学生協会の共同会長として、彼女はパズドラ ルーレットの学生と教員の間の連絡役としての役割を果たし、両者を結び付けるイベントをコーディネートしています。あなたの玄関でお手伝い、彼女は高齢者や障害者からの食料品リストをコンピューター プログラムに入力し、地域のメンバーと調整して指定された注文を配達します。
昨年の夏、彼女はジョンソン・エンド・ジョンソンのUROP奨学生プログラムに受け入れられ、夏学期中MITでSTEMパズドラ ルーレットに取り組む約20人の女性学部生に加わりました。彼女の同僚は、科学分野の大学院でのキャリアを対象とした教員のプレゼンテーション、ワークショップ、ネットワーキング イベントに参加しました。
「あのプログラムには本当に感謝しました。社会規範のせいで、多くの女性が科学を恐れていると思うからです」と彼女は言います。 「最初はコンピューター サイエンスや数学が得意ではないと思っていたのを覚えています。今では両方のスキルとウェット ラボ技術を組み合わせてパズドラ ルーレットしています。」
つい最近、チャクラボルティは 2017 ～ 2018 年の賞を受賞しましたバリー・ゴールドウォーター奨学金賞、大学教員によって推薦された全国の候補者の中から選ばれます。彼女はこの夏もキャンパスに残り、教員指導によるパズドラ ルーレットを行う予定です。パズドラ ルーレットT アムジェン奨学生プログラム.
2019 年に卒業した後、チャクラボルティさんはパズドラ ルーレット関連の分野、おそらく計算パズドラ ルーレットで博士号を取得するつもりです。その後の選択肢は無限です - 教授、コンサルタント、研究科学者。
「自分が正しい方向に進んでいることはわかっています。難しい課題を終えたり、パズドラ ルーレット室で新しいアプローチを見つけたりするたびに、そう思うからです」と彼女は言います。 「友人や指導者の助けを得てそのような課題を達成すると、誇りの気持ちと、たった 1 学期でどれだけ学んだか信じられないという気持ちになります。